Kiiminkijoki on ollut lähihistoriamme ajan Perämeremme merkittävimpiä luonnontilassa säilyneitä arvokalojen lisääntymisalueita. Jokeen on noussut kutemaan lähes kaikki vesistömme jalokalat kuten siika, harri, taimen ja lohi. Lisäksi jokeen on noussut runsaasti nahkiaisia. Joessa on asunut viime vuosisadan loppupuolelle asti merkittävä jokirapukanta. Tavanomaisimmat vapakalastajillekin tutut kalalajit, kuten hauki, ahven, made, salakka, mutu, särki, säynävä, seipi ja lahna tarttuvat edelleen hanakasti pyytäjien koukkuun.